巣箱からとり上げて埋めてあげた方が良いと思います、
人の匂いがついて育児放棄するなら、
親鳥さんを触りまくって巣箱から雛を取り上げた人の匂いをつければごまかせるような気がします、
そのまま腐ってしまうと、雛や親鳥にいい影響を与えないと思います、もしかして、既に育児放棄されているのでは？生きている子のそのうに餌が入っていないようなら、放棄している可能性が有ると思いますが、その子達を見て直接飼育している訳ではないので間違っていたらお許しを！

こざくらさん、お返事ありがとうございます。

やはり出したほうがいいんですね。

明日、もう一度確認してみます。

一番最初に生まれた子はそのうが大きく出てるみたいなんですが、すぐに母鳥が見てると肩に乗ってきてなかなかゆっくり確認が取れずにいます。

ありがとうございました。